インボイス登録後の確定申告やり方|消費税申告が必要になった個人事業主向けガイド


インボイス制度に登録したものの、「今年の確定申告はどう変わるの?」「消費税申告って何をすればいいの?」と不安を感じている個人事業主の方は多いのではないでしょうか。これまで所得税の確定申告だけで済んでいたのに、消費税の申告も必要になり、会計処理も複雑になるため、混乱するのも無理はありません。

この記事では、インボイス登録後に初めて消費税申告をする個人事業主・フリーランスに向けて、確定申告の具体的なやり方を徹底解説します。所得税申告との違い、消費税の計算方法、必要書類、申告期限、会計ソフトの活用法まで、実務に即した情報をお届けします。

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インボイス登録後の確定申告で変わる3つのポイント

インボイス制度(適格請求書等保存方式)に登録すると、確定申告の内容が大きく変わります。まずは全体像を把握しましょう。

1. 消費税の申告・納税義務が発生

これまで免税事業者だった個人事業主は、インボイス登録により課税事業者となります。そのため、所得税の確定申告に加えて、消費税の確定申告が必要になります。

ポイント: 消費税の申告期限は、個人事業主の場合、翌年3月31日までです。所得税の確定申告(3月15日)とは期限が異なるため注意が必要です。

2. 会計処理が「税込」から「税抜」へ

免税事業者時代は税込経理が一般的でしたが、課税事業者になると税抜経理が推奨されます。売上や経費を本体価格と消費税に分けて記帳する必要があります。

3. インボイス(適格請求書)の保存義務

仕入税額控除を受けるためには、取引先から受け取った適格請求書(インボイス)を保存しなければなりません。請求書や領収書の管理がより重要になります。

インボイス登録後の確定申告フロー図
インボイス登録後は所得税と消費税の両方の申告が必要に

消費税申告の基本:2つの計算方法を理解する

消費税の計算方法には、原則課税(本則課税)簡易課税の2種類があります。どちらを選ぶかで納税額が大きく変わることもあるため、自分に適した方法を選びましょう。

原則課税(本則課税)とは

売上で預かった消費税から、仕入や経費で支払った消費税を差し引いて計算する方法です。

計算式:
納付税額 = 売上の消費税 − 仕入・経費の消費税

メリット:

  • 経費が多い事業者は税額を抑えられる
  • 設備投資が多い年は還付を受けられる可能性がある

デメリット:

  • すべての取引について消費税を区分する必要がある
  • インボイスの保存・管理が必須
  • 記帳が複雑になる

簡易課税とは

売上の消費税に業種ごとの「みなし仕入率」を掛けて、仕入税額控除を計算する簡易的な方法です。

計算式:
納付税額 = 売上の消費税 − (売上の消費税 × みなし仕入率)

事業区分 業種例 みなし仕入率
第一種 卸売業 90%
第二種 小売業 80%
第三種 製造業、建設業 70%
第四種 飲食業 60%
第五種 サービス業 50%
第六種 不動産業 40%

メリット:

  • 経費の消費税を細かく計算しなくてよい
  • インボイスの保存は不要(売上分のみ発行義務あり)
  • 記帳が比較的シンプル

デメリット:

  • 基準期間の課税売上高が5,000万円以下でないと選択できない
  • 事前に「消費税簡易課税制度選択届出書」の提出が必要
  • 経費率が高い場合、原則課税より不利になることがある
注意: 簡易課税を選択する場合、適用を受けようとする課税期間の開始日の前日までに届出書を提出する必要があります。インボイス登録と同時に簡易課税を選択する場合は、登録申請書に同時提出することができます。

インボイス登録後の確定申告:具体的な手順

ここからは、実際の確定申告の流れを、ステップごとに解説します。

STEP 1: 会計帳簿の記帳を完了させる

1年間の売上・経費を会計ソフトや帳簿に記録します。インボイス登録後は、消費税区分を正確に記録することが重要です。

  • 課税売上(10%):商品販売、サービス提供など
  • 課税売上(軽減8%):飲食料品、新聞など
  • 非課税売上:住宅の賃貸料、土地の譲渡など
  • 不課税取引:給与、祝金など
STEP 2: 消費税の計算をする

原則課税または簡易課税で、納付すべき消費税額を計算します。会計ソフトを使用すれば自動計算されるため、手計算のミスを防げます。

会計ソフトでの消費税計算画面イメージ
会計ソフトなら消費税額が自動計算される
STEP 3: 消費税申告書を作成・提出する(3月31日まで)

必要な申告書類:

  • 消費税及び地方消費税の確定申告書(一般用または簡易課税用)
  • 付表1-3(税率別消費税額計算表兼地方消費税の課税標準となる消費税額計算表)
  • 付表2-3(課税売上割合・控除対象仕入税額等の計算表)※原則課税の場合
  • 付表5-3(控除対象仕入税額の計算表)※簡易課税の場合

提出方法は以下の3つです:

  • e-Tax(電子申告):24時間提出可能、控えも即座に受領
  • 税務署に持参:窓口で提出
  • 郵送:消印日が提出日となる
STEP 4: 所得税の確定申告をする(3月15日まで)

消費税申告とは別に、従来どおり所得税の確定申告も必要です。青色申告と白色申告どっちがお得?メリット・デメリット徹底比較【2024年版】を参考に、適切な申告方法を選びましょう。

ポイント: 税抜経理方式を採用している場合、所得税の確定申告書には消費税抜きの金額を記載します。消費税の納税額は経費にならない点に注意してください。
STEP 5: 消費税を納付する(3月31日まで)

納付方法は複数あります: