# IT・Web業界向け会計ソフト比較｜プロジェクト管理連携とエンジニアに人気のツール

IT・Web業界で働くフリーランスエンジニアやシステム開発者の皆さんは、複数プロジェクトの収支管理や請求書発行、確定申告準備に多くの時間を取られていませんか？開発作業に集中したいのに、経理業務が後回しになって年度末に慌ててしまうというお悩みは、この業界特有の課題です。一般的な会計ソフトでは、プロジェクト別の収支管理やGitHub・Slackなどの開発ツールとの連携が不十分で、かえって手間が増えてしまうこともあります。

本記事では、IT・Web業界に特化した会計ソフトの選び方から、エンジニアに人気の具体的なツール比較、プロジェクト管理との連携方法まで、実務に即した情報を網羅的に解説します。freee・マネーフォワード・弥生といった主要ソフトのIT業界向け機能比較はもちろん、GitHub連携やAPI活用、タイムトラッキングツールとの統合といった技術的な観点からも詳しくご紹介します。

この記事を読めば、あなたの業務スタイルに最適な会計ソフトが見つかり、経理作業の効率化によって本業の開発に集中できる環境を整えられます。年間50時間以上の経理時間削減も決して夢ではありません。

IT・Web業界における会計管理の特殊性と課題

複数プロジェクトの並行管理が必須

IT・Web業界のフリーランスや小規模事業者は、同時に複数のクライアントプロジェクトを抱えることが一般的です。例えば、Webアプリケーション開発案件とWordPressサイト制作案件を同時進行しながら、既存システムの保守契約も継続しているといった状況は珍しくありません。

この場合、各プロジェクトごとに収入・支出を分けて管理し、プロジェクト別の粗利率を把握することが経営判断において極めて重要になります。一般的な会計ソフトでは「売上」「経費」といった勘定科目ベースの管理しかできず、どのプロジェクトがどれだけ利益を生んでいるのか見えにくいという課題があります。

継続課金と変動売上の混在

IT業界では、月額保守契約やSaaSサービスによる継続課金（MRR：Monthly Recurring Revenue）と、スポット開発による一時的な売上が混在することが多くあります。freeeやマネーフォワードでは、定期請求書機能を使って毎月自動で請求書を発行できるため、継続課金の管理工数を大幅に削減できます。

• 継続課金の例: 月額5万円のシステム保守契約、年額60万円のサーバー運用管理
• 変動売上の例: Webサイト制作案件80万円、アプリ開発案件300万円
• 成果報酬の例: 広告運用代行（広告費の20%）、アフィリエイト収入

これらを正確に記録し、月次・年次でキャッシュフローを予測できる会計ソフトが求められます。

経費の特殊性と按分の複雑さ

エンジニアやWeb制作者の経費には、一般業種とは異なる特徴があります。AWSやGCP、Azureといったクラウドサービス利用料、Adobe Creative Cloudなどのサブスクリプション、技術書籍やオンライン学習プラットフォームの費用、開発用PCやディスプレイなどの機器購入費など、IT特有の経費項目が多数存在します。

さらに、自宅兼事務所で働く場合は、家賃・光熱費・通信費の按分計算が必要になります。例えば、50㎡の自宅のうち10㎡を専用作業スペースにしている場合、家賃の20%を経費計上できる可能性があります。

詳しい経費計上の基準については、フリーランスエンジニアの経費はどこまでOK？認められる経費一覧と節税術で詳しく解説しています。

請求サイクルと入金管理の複雑さ

IT業界では、請求から入金までのサイクルが案件によって大きく異なります。「月末締め翌月末払い」が一般的ですが、大手企業相手の場合は「月末締め翌々月10日払い」といった長期サイトもあります。また、成果物の検収が完了してからの請求となるため、予定していた月に入金されないケースも頻発します。

会計ソフトには、請求書発行から入金確認、未入金の督促管理までを一元管理できる機能が求められます。特にfreeeやマネーフォワードでは、銀行口座と連携して入金を自動照合し、未入金の取引を一目で確認できる機能があります。

IT業界向け会計ソフトを選ぶ7つの重要基準

1. プロジェクト別収支管理機能の有無

最も重要な基準が、プロジェクト単位で収入と支出を紐付けて管理できるかという点です。主要な会計ソフトでは以下のような機能で対応しています。

会計ソフト	プロジェクト管理方法	レポート機能
freee	タグ機能、プロジェクト機能（有料プラン）	タグ別損益レポート、プロジェクト別レポート
マネーフォワード	部門管理機能、タグ機能	部門別損益計算書、タグ別集計
弥生会計	補助科目、メモタグ（一部プラン）	補助科目別集計表
会計freee（上位プラン）	プロジェクトコード、セグメント管理	セグメント別PL、プロジェクト収支分析

例えば、年間売上1,200万円のフリーランスエンジニアAさんの場合、プロジェクトAで600万円、プロジェクトBで400万円、プロジェクトCで200万円の売上があったとします。それぞれのプロジェクトで発生した経費を紐付けることで、プロジェクトAの粗利率は40%、プロジェクトBは25%、プロジェクトCは60%といった分析が可能になり、次年度の営業戦略を立てる重要な判断材料になります。

2. API連携とツール統合の柔軟性

エンジニアにとって、日常使用している開発ツールやプロジェクト管理ツールと会計ソフトが連携できるかは業務効率に直結します。主要な連携としては以下があります。

• プロジェクト管理ツール: Backlog、Redmine、Jira、Asana、Trello
• タイムトラッキング: Toggl Track、Clockify、TimeCrowd
• 請求書・見積もり: Misoca、board、RECEIPT POST
• コミュニケーション: Slack、Chatwork
• 決済サービス: Stripe、PayPal、Square

freeeは公式APIが充実しており、開発者向けドキュメントも整備されています。自分でスクリプトを書いて自動化したいエンジニアには最適です。例えば、Toggl Trackで記録した作業時間を自動的にfreeeの請求書に反映させるといった連携が実現できます。

3. クラウドサービス支出の自動取得

AWS、GCP、Azure、Heroku、Netlifyなど、クラウドサービスの利用料は毎月変動します。これらをクレジットカード明細から自動取得し、自動で経費計上できる機能は大きな時間節約になります。

主要会計ソフトはいずれも銀行口座・クレジットカード連携機能を持っていますが、自動仕訳の学習精度に差があります。freeeとマネーフォワードはAIによる自動仕訳学習機能があり、「AWS利用料→通信費」「GitHub有料プラン→ソフトウェア使用料」といったパターンを学習して、次回から自動で正しい勘定科目を提案してくれます。

4. 請求書作成と定期請求の自動化

IT業界では、月次の保守契約や継続コンサルティング契約など、定期的に同じ内容の請求書を発行するケースが多くあります。毎月手動で請求書を作成するのは非効率的です。

freeeとマネーフォワードでは「定期請求書」機能があり、初回設定さえしておけば、毎月自動で請求書を作成・送信できます。さらに、請求書のPDF生成、メール送信、入金確認まで自動化できるため、請求業務にかかる時間を月間5〜10時間削減できます。

• 請求書テンプレート: 自社ロゴ入りのカスタマイズ可能なテンプレート
• 多言語対応: 英語の請求書作成（海外クライアント向け）
• 電子インボイス対応: 2023年10月開始のインボイス制度に完全対応
• 郵送代行サービス: 請求書の印刷・郵送を代行（有料オプション）

5. 青色申告・確定申告の自動化レベル

フリーランスや個人事業主にとって、年に一度の確定申告は大きな負担です。IT業界向け会計ソフトでは、日々の取引を記録しておくだけで、確定申告書類を自動生成できる機能が必須です。

特に青色申告で最大65万円の特別控除を受けるには、複式簿記による記帳とe-Taxでの電子申告が必要です（2020年分以降）。freee・マネーフォワード・弥生いずれも、e-Tax連携機能があり、会計ソフト上から直接電子申告が可能です。

詳しい青色申告の要件については、青色申告65万円控除の要件とは？2024年最新版｜e-Tax必須化の注意点で詳しく解説しています。

6. モバイル対応とレシート撮影機能

外出先での打ち合わせや、技術書の購入、カフェでの作業など、IT業界では移動が多い働き方も一般的です。スマートフォンアプリでレシートを撮影するだけで自動的に経費登録できる機能は、記帳漏れを防ぐ上で非常に有効です。

freee・マネーフォワード・弥生いずれもスマホアプリを提供していますが、レシート読み取り精度にはやや差があります。freeeはAI-OCR技術により、領収書の金額・日付・店名を高精度で読み取り、自動で経費科目を提案してくれます。

• 撮影だけで完了: レシート撮影→自動読み取り→勘定科目自動提案→登録
• レシート保管の電子化: 電子帳簿保存法に対応した電子保管
• 外貨レシート対応: 海外出張時の外貨建てレシートも円換算

7. サポート体制と学習リソース

会計初心者のエンジニアにとって、わからないことがあったときにすぐにサポートを受けられるかは重要です。主要会計ソフトのサポート体制を比較すると以下のようになります。

会計ソフト	メールサポート	チャットサポート	電話サポート	学習コンテンツ
freee	全プラン対応	全プラン対応	上位プランのみ	ヘルプセンター、動画多数
マネーフォワード	全プラン対応	全プラン対応	上位プランのみ	使い方ガイド、FAQ充実
弥生	全プラン対応	プランによる	全プラン対応（業界最長）	業界最大規模のサポート体制

弥生は「業界最大規模のカスタマーセンター」を強みとしており、電話サポートの繋がりやすさでは定評があります。一方、freeeとマネーフォワードはチャットサポートがリアルタイムで対応してくれるため、作業中の疑問をすぐに解決できます。

▲ IT業界向け会計ソフトの選び方解説動画

主要会計ソフトのIT業界向け機能徹底比較

freee会計：エンジニアに最も人気の理由

freee会計は、IT・Web業界のフリーランスや小規模事業者に最も支持されている会計ソフトです。その理由は、直感的なUI、充実したAPI、そしてプロジェクト管理に特化した機能にあります。

freeeのIT業界向け主要機能

• タグ機能によるプロジェクト管理: 収入・支出に複数のタグを付けて多軸分析が可能
• API連携の充実: 公式APIドキュメントが整備され、独自ツールとの連携が容易
• Stripe・PayPal連携: オンライン決済の売上を自動取り込み
• GitHub連携（サードパーティ）: Zapier経由でissueやcommitと連携
• Slack通知: 請求書送付や入金確認をSlackに通知

実際の利用例として、年収800万円のフリーランスWebエンジニアBさんは、freeeのタグ機能で「案件A」「案件B」「自社サービス開発」の3つに分類し、毎月のキャッシュフロー分析を行っています。その結果、自社サービス開発は初期投資で赤字だが、将来的なストック収入になると判断し、継続投資を決定しました。

freeeの実際の評判や口コミについては、freee確定申告の評判は？実際に使った個人事業主100人の口コミ調査で詳しく紹介しています。

マネーフォワード クラウド会計：部門管理と高度な分析

マネーフォワード クラウド会計は、会計の専門性と使いやすさのバランスが取れたソフトです。特に部門管理機能が充実しており、複数事業を展開するIT事業者や、将来的に法人化を視野に入れている個人事業主に適しています。

マネーフォワードのIT業界向け主要機能

• 部門管理機能: プロジェクト・事業部門ごとの損益を完全に分離管理
• API連携: 開発者向けAPIが公開されており、自動化が容易
• レポート機能: 部門別PL、キャッシュフローレポート、月次推移など多彩
• マネーフォワードシリーズ連携: 給与計算、経費精算、勤怠管理と一元化
• 電子契約連携: クラウドサインなど電子契約サービスとの連携

例えば、Web制作とシステム開発の2事業を行っている法人成りを検討中のフリーランスCさんは、マネーフォワードの部門管理機能で「Web制作部門」「システム開発部門」に分けて管理しています。これにより、法人化した際にスムーズに移行でき、事業ごとの採算性も明確に把握できています。

弥生会計オンライン：初心者向けの手厚いサポート

弥生会計オンラインは、会計ソフト業界で最も長い歴史を持ち、初心者向けのサポート体制が最も充実しています。IT業界の中でも、会計知識がほとんどない初心者エンジニアに特におすすめです。

弥生のIT業界向け主要機能

• かんたん取引入力: 簿記知識不要で直感的に入力可能
• スマート取引取込: 銀行・カード明細、レシート撮影での自動取込
• 確定申告e-Taxモジュール: 電子申告が簡単に完結
• 業界最大規模のサポート: 電話・メール・チャット・画面共有サポート
• Misoca連携: 弥生の請求書ソフト「Misoca」と完全連携

ただし、弥生はAPI公開が限定的で、サードパーティツールとの連携は他社に比べて弱いという点に注意が必要です。エンジニアとして自動化を重視する場合は、freeeやマネーフォワードの方が適しています。

3大会計ソフトの総合比較表

比較項目	freee	マネーフォワード	弥生
プロジェクト管理	◎ タグ・プロジェクト機能	◎ 部門管理機能	△ 補助科目のみ
API連携	◎ 充実	◎ 充実	△ 限定的
初心者向け	◯ 直感的UI	◯ やや会計寄り	◎ 最も親切
サポート体制	◯ チャット・メール	◯ チャット・メール	◎ 電話サポート充実
料金（年額）	11,760円〜	9,600円〜	初年度無料〜
総合評価	エンジニア向け最適	法人化見据える人向け	会計初心者向け

より詳しい比較は、freee vs マネーフォワード vs 弥生｜個人事業主向け会計ソフト徹底比較2024をご覧ください。

プロジェクト管理ツールとの連携実践ガイド

Backlog × freee連携で工数と収支を一元管理

Backlogは国内で最も人気のあるプロジェクト管理ツールの一つで、特にWeb制作会社やシステム開発会社で広く使われています。BacklogとfreeeをAPI連携することで、工数管理と会計管理を統合できます。

連携の具体的な流れ

1. Backlogでプロジェクトと課題を作成: 各案件をプロジェクトとして登録し、作業をタスク（課題）として管理
2. 工数を記録: Backlogの時間管理機能で各タスクにかかった時間を記録
3. Zapierで自動連携: Zapierのワークフローで、Backlogの課題完了をトリガーにfreeeの請求書を自動生成
4. freeeで請求・入金管理: 自動生成された請求書を送付し、入金確認まで一元管理

例えば、時間単価5,000円で働くフリーランスDさんは、Backlogで「案件X：Webサイト制作」に合計80時間を記録しました。Zapierの自動化により、freeeで「案件X：400,000円（80時間×5,000円）」の請求書が自動生成され、工数管理から請求まで完全に自動化されています。

Toggl Track × マネーフォワードでタイムトラッキング自動請求

Toggl Trackは、シンプルで使いやすいタイムトラッキングツールとして、多くのフリーランスエンジニアに愛用されています。作業時間を記録し、その時間をもとに自動的に請求書を作成する仕組みを構築できます。

Toggl Track × マネーフォワード連携の設定手順

この仕組みにより、月初5日以内に前月分の請求書を完全自動で作成できるようになり、請求業務の時間を月間10時間以上削減できたという事例があります。

GitHub連携で開発工数を可視化

エンジニアにとって、GitHubは日常的に使うツールです。commitやpull request、issueといったGitHub上の活動データを会計情報と紐付けることで、より詳細なプロジェクト分析が可能になります。

例えば、GitHub APIを使って「リポジトリAに対するcommit数」「issue解決数」を取得し、それを工数の指標としてfreeeのプロジェクトタグに関連付けます。これにより、「このプロジェクトはcommit数に対して収益が低い＝効率が悪い」といった分析ができ、次回の見積もり改善に活かせます。

IT業界特有の経費管理と自動化テクニック

クラウドサービス利用料の勘定科目と按分方法

IT業界で特に重要なのが、AWS、GCP、Azure、Herokuなどのクラウドサービス利用料の経費処理です。これらは「通信費」または「外注費」として計上するのが一般的ですが、使用目的によって分けることもできます。

クラウドサービス	主な用途	推奨勘定科目	備考
AWS / GCP / Azure	サーバー・データベース	通信費 or 外注費	プロジェクト別に按分可能
GitHub	ソースコード管理	通信費	Pro版は月$4、Team版は月$4/ユーザー
Slack / Chatwork	コミュニケーション	通信費	ビジネスプランは全額経費化可
Adobe Creative Cloud	デザイン・動画編集	ソフトウェア使用料 or 消耗品費	Web制作・デザイナーは必須
Notion / Evernote	ドキュメント管理	消耗品費	業務利用の範囲内で経費化
Udemy / Coursera	技術学習	研修費 or 新聞図書費	業務に直結する内容に限る

特にAWSやGCPは、複数プロジェクトで共用することが多いため、プロジェクト別の按分が必要になります。freeeやマネーフォワードでは、1つの取引を複数のプロジェクトタグや部門に按分して登録できる機能があります。

サブスクリプション支払いの自動仕訳設定

IT業界では、毎月決まった金額のサブスクリプション支払いが多数発生します。これらを毎月手動で入力するのは非効率です。freeeとマネーフォワードには、クレジットカード明細から自動学習して仕訳を提案する機能があります。

自動仕訳の設定手順（freeeの例）

1. クレジットカード連携: freeeにクレジットカードを登録し、明細を自動取得
2. 初回の仕訳登録: 「GitHub Pro $4」→「通信費」として登録
3. 自動学習: 次回以降、同じ取引先・金額の場合、自動的に「通信費」を提案
4. 自動登録ルール: さらに進んで、特定の取引先を「自動登録ルール」に設定すれば、完全自動化

年収600万円のフリーランスエンジニアEさんは、月20件程度のサブスク支払いがありましたが、自動仕訳設定により記帳時間を月間3時間から30分に短縮できました。

技術書・オンライン学習費用の経費計上基準

エンジニアにとって、技術書の購入やUdemy・Courseraなどのオンライン学習は業務に不可欠です。これらは「研修費」「新聞図書費」「消耗品費」として経費計上できますが、以下の基準を満たす必要があります。

• 業務との直接的な関連性: 現在または近い将来の業務に直結する内容であること
• 合理的な範囲: 年収に対して過度に高額でないこと（目安：年収の5〜10%以内）
• 記録の保持: 何を学んだか、どう業務に活かしたかを記録しておく

例えば、Reactを使ったフロントエンド開発を受注しているエンジニアが「React完全ガイド」のUdemy講座（2,400円）を購入した場合、明らかに業務関連性があるため経費化できます。一方、全く異なる分野（例：中国語会話）の学習費用は、業務関連性を説明できない限り経費化は難しいでしょう。

経費として認められる範囲の詳細は、フリーランスエンジニアの経費はどこまでOK？認められる経費一覧と節税術で網羅的に解説しています。

開発機器・PCの減価償却と一括償却の選択

MacBook Pro、高性能デスクトップPC、デュアルディスプレイなど、エンジニアは高額な機器を購入することがあります。10万円以上の資産は原則として減価償却が必要ですが、30万円未満であれば「少額減価償却資産の特例」を使って一括経費化できます。

取得価額	処理方法	メリット	注意点
10万円未満	全額即時経費	処理が簡単	特になし
10〜20万円	一括償却資産（3年均等償却）	償却資産税の対象外	3年間で分割
20〜30万円	少額減価償却資産（全額即時経費）	初年度に全額控除	青色申告者のみ、年間300万円まで
30万円以上	通常の減価償却（4年）	正規の会計処理	PC・サーバーは耐用年数4年

例えば、28万円のMacBook Proを購入した青色申告の個人事業主は、「少額減価償却資産の特例」を使って全額を購入年度の経費にできます。これにより、所得を28万円圧縮でき、所得税・住民税で約8〜12万円の節税効果があります（税率により異なります）。

freee・マネーフォワード・弥生いずれも、固定資産の登録機能があり、減価償却を自動計算してくれます。購入時に「固定資産として登録」を選ぶだけで、毎年の減価償却費が自動で計上されます。

▲ IT業界フリーランスの経費管理と節税テクニック解説

確定申告をラクにするIT業界向け活用法

e-Tax連携で最大65万円の青色申告特別控除

2020年分の確定申告から、青色申告で最大65万円の特別控除を受けるには、e-Taxによる電子申告または電子帳簿保存が必須となりました。freee・マネーフォワード・弥生いずれも、ソフト上から直接e-Tax送信ができる機能を備えています。

e-Tax電子申告の準備手順